Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms