Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vwa5b2Q3UR50 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vwa5b2Q3UR50 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms