Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms