Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Rnf180Q3U827 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf180Q3U827 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf180Q3U827 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf180Q3U827 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf180Q3U827 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rnf180Q3U827 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Rnf180Q3U827 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf180Q3U827 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rnf180Q3U827 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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