Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Otx1P80205 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx1P80205 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms