Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL20P78556 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL20P78556 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL20P78556 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL20P78556 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL20P78556 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCL20P78556 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCL20P78556 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CCL20P78556 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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