Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shox2P70390 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shox2P70390 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms