Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sipa1P46062 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms