Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1aP36536 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms