Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tfap2aP34056 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms