Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms