Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc8P09025 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms