Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms