Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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