Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r39G3UWE6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r39G3UWE6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms