Protein–RNA interactions for Protein: F6XVS9

Gm8922, Predicted gene 8922, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8922F6XVS9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8922F6XVS9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms