Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pgbd1E9Q492 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pgbd1E9Q492 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pgbd1E9Q492 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pgbd1E9Q492 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pgbd1E9Q492 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pgbd1E9Q492 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pgbd1E9Q492 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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