Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkd2l1A2A259 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms