Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms