Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms