Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms