Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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