Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms