Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calr3Q9D9Q6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms