Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam90a1bQ9D4F3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms