Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms