Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms