Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRG4Q92954 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms