Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csmd1Q923L3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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