Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atl3Q91YH5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms