Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssuh2Q8C3L1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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