Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc29Q80VM3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttc29Q80VM3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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