Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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LcorQ6ZPI3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LcorQ6ZPI3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
LcorQ6ZPI3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorQ6ZPI3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorQ6ZPI3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorQ6ZPI3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorQ6ZPI3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorQ6ZPI3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorQ6ZPI3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorQ6ZPI3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorQ6ZPI3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LcorQ6ZPI3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms