Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc85bQ6PDY0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms