Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms