Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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