Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms