Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp13a3Q5XF89 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms