Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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