Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Urb1Q571H0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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