Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TchpQ3TVW5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms