Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Treml4Q3LRV9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms