Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnb1Q03717 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms