Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms