Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms