Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo40P62932 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo40P62932 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms