Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg3P47867 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg3P47867 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg3P47867 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms