Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mmp9P41245 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Mmp9P41245 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Mmp9P41245 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Mmp9P41245 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mmp9P41245 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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