Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms