Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rag1P15919 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms